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在这里记录下我的台式机跑DPABISurf做功能脑网络分析的流程。
cpu：i7-11700k，内存：64g，平台：Linux20.04LST
DPABIV6.0_210501，DPABISurf1.6
这次跑的数据不多，20个被试。

一、运行时间

开始时间：2021年10月10日16点46分

结束时间：2021年10月11日，23点59分

运行选项：DPABISurf Pipeline默认的所有参数，包括数据预处理，alff，reho，dc等等，没有Functional Connectivity。

parallel works 我设置的是8，因为这颗cpu是8核心（后悔了贪便宜了，当时应该选择i9的cpu，有10核心），所以这次20个数据跑了3个周期。

数据预处理+计算常用指标，程序一共跑了32小时13分钟。
11日晚上6点左右的时候，其实就已经开始跑Degree Centrality了，中午还在fmriprep，所以DC大概跑了6个小时以上（不足12小时）。
在跑的过程中，cpu负载是最高100%，最低50%。

所以如果用我的台式机配置的话，1次跑8个被试，跑完数据的预处理（主要是皮层重建耗时间）需要8小时。如果加上reho，alff，DC的计算，大概需要4小时吧。

二、硬盘内存变化

20个被试，初始的FunRaw和T1Raw加一起，是2.6GB，

跑完上面的程序（数据预处理和一些指标），最后是250.4GB

好家伙，20个被试就是250G，我这1t的固态满打满算也就够50个被试数据。

通过这次经历，我发现我目前最需要的就是加一块2t的固态硬盘，看来贫穷才是科研的第一限制因素。

（福利：附上我的学习笔记，未完待续）

本文标签： 过程LinuxDPABISurf

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