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2024年4月3日发(作者:)
Ubuntu 14.04 系统下安装 Gromacs 4.6.5
对于初学者来说安装软件比较麻烦,在网上找到安装教程往往安
装步骤不全,不能完全安装,导致安装失败,我是刚入门小白,把安
装经验记录下来供大家参考。
本文描述了在 Ubuntu 14.04 系统下安装 Gromacs 4.6.5(CPU 版和 GPU版)
的详细步骤。
第一步
.
安装
CUDA (在线安装,下载速度有点慢,要有耐心啊)
转自 /xizero00/article/details/43227019
首先验证你是否有nvidia的显卡(
/cuda-gpus
这个网站查看你
是否有支持gpu的显卡):
$ lspci | grep -i nvidia
查看你的linux发行版本(主要是看是64位还是32位的):
$ uname -m && cat /etc/*release
看一下gcc的版本:
$ gcc --version
首 先下载nvidia cuda的仓库安装包(我的是ubuntu 14.04 64位,所以下载的是
ubuntu14.04的安装包,如果你是32位的可以参看具体的地址,具体的地址是
/cuda-downloads)
wget /compute/cuda/repos/ubuntu1404/x86_64/cuda-
repo-ubuntu1404_6.5-14_
下载完成之后可以使用如下命令安装它,注意文件名修改为cuda-repo-ubuntu1404_6.5-
14_
sudo dpkg -i cuda-repo-
安装好仓库之后,就可以更新你的本地仓库。
sudo apt-get update
最后开始安装cuda以及显卡驱动(安装cuda的同时就会把显卡驱动也全部安装好,这个真
的很方便。但是下载的时间有点长。)
sudo apt-get install cuda
需要注意的是,我这里提供的安装方法跟网络上各种安装方法都不一样,他们的方法往往很
复杂
主要是因为:(1)有些教程是手工安装显卡的驱动程序,手工屏蔽系统的默认开源的驱动
(2)安装cuda也是手工进行
使用这个方法的时候千万要注意几个问题:
(1)cuda6.5已经不支持老旧的显卡了所以sm11 等等都必须删除。可以参考我的另一个
文章,关于编译opencv3.0的
(2)ubuntu14.04是64位的,并且不要一开始就更新系统补丁什么的,因为系统更新过之
后,再安装显卡驱动就会无法进入图形界面,我查看了相关的日志发现是卡在了dbus那
边。所以,我建议一安装好ubuntu 14.04就不要更新系统补丁。
安装完之后你需要设置环境变量:
$ export PATH=/usr/local/cuda-6.5/bin:$PATH
$ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-6.5/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
设置完毕之后,你还可以选择是否安装cuda附带的示例代码(
你可以将
$
接下来做一些验证工作:
查看显卡的驱动版本
cat /proc/driver/nvidia/version
查看nvcc编译器的版本
nvcc -V i
编译cuda的示例代码:
cd ~/NVIDIA_CUDA-6.5_Samples
然后make一下编译代码。
进入bin路径运行devicequery
cd ~/NVIDIA_CUDA-6.5_Samples/bin
./ deviceQuery
具体的安装过程可以参考英文。
版权声明:本文标题:GPU(CPU)版安装gromacs完整步骤 内容由热心网友自发贡献,该文观点仅代表作者本人, 转载请联系作者并注明出处:https://m.elefans.com/xitong/1712090753a342678.html, 本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容,一经查实,本站将立刻删除。
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