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vbm8使用手册 中文
http://wenku.baidu/view/ea101c30eefdc8d376ee323f.html
vbm5处理流程
http://wenku.baidu/view/cd9b5ac20c22590102029d98.html?re=view
vbm8使用手册 英文
静息态论坛的一些讨论：
http://restfmri/forum/node/1997全脑体积的影响作为协变量去除掉，但是应该使用原始空间的c1还是使用wc1或者mwc1作为协变量呢？
http://restfmri/forum/node/1345 How
to get a mean grey matter map as a mask?
mwc1***.img的是灰质体积wc1***.img的是灰质密度mwc2***.img的是白质体积wc2***.img的是白质密度
c3那个是csf
http://restfmri/forum/node/1784 你说的各种segmentation的办法，现在有直接分割，即vbm和spm里面的segmentation，我记得这种segmentation叫unified
segmentation，
http://restfmri/forum/node/2014 wc1*(wc2*)，mwc1*(mwc2*)及smwc1*(smwc2*)用于后续计算灰质(白质)密度和体积。其余的都可以删掉。
http://restfmri/forum/node/1686 我想加入灰质萎缩做协变量，那么是加入wc1*图像还是mwc1图像？mwc1图像是灰质密度还是灰质体积？谢谢指导
dparsf-A 版本里也有vbm的处理模板。
全脑体积计算软件：volume one和IBASPM-----vbm可以计算
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VBM-学习汇总
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非常感谢Li老师的耐心指导VBM的学习。我以前误认为：在功能像与结构像进行配准，结构像分割的那部的数据即可用于VBM分析。Dpabi-dparsfA有对VBM的处理功能，非常简单；FSL-VBM；SPM-VBM如下将详细介绍：
prepare your T1-weighted images in
the right format
fslvbm_1_bet -
carry out brain extraction on all T1 images
fslvbm_2_template -
create the study-specific symmetric grey matter
template 生成模板这步：需要将不同组人数不同的弄成等组人数，来产生模板。即：A组15人，B组20人。那生成模板时，B组要选取15人，A组继续使用15人，即等组人数来生成模板。----这也是与SPM-VBM不同的地方：即SPM-VBM使用该程序里默认模板，不需要生成组模板再进行后续分析。
fslvbm_3_proc -
register all the grey matter images to the template, modulate and
smooth them with different kernel sizes and finally runs an initial
GLM analysis for qualitative evaluation
randomise - carry
out voxelwise GLM analysis using permutation testing
SPM-VBM的汇总(基于VBM8-manual的汇总)
大致流程：“preprocessing---> quality
check ---> smoothing---> statistical analysis”
其中，preprocessing主要基于VBM下Estimate and write文件
quality check主要基于VBM下check data quality文件
Smoothing和statistical analysis主要基于SPM8的工作目录进行。
preprocessing主要基于VBM下Estimate and write文件可以直接用默认文件：在manual中，也详细介绍了非默认的方法。
1.
Estimation Options-对于非儿童被试，都选择默认参数，对于儿童被试需要制作自己的模板customized
Tissue Probability
Maps。关于儿童这块制作，manual后面有详细介绍。
2.
Extended Options-可以选择high-dimensional DARTEL
normalization，而非默认的low—dimensional: SPM default. 即
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