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2024年6月9日发(作者:)
DTI数据处理流程:
一、原始数据格式转换
软件:MRIcroN中的
步骤:
1、打开软件,选择Output Format:4D NIfTI hdr/img
2、选择要转换的数据(.dcm文件)所在的文件夹,并选择输出数据存放的文件夹(在
help中可选择,默认与原始数据在统一文件夹),数据自动转换,转换完成后提示如上
图。可以将这个内容用记事本保存下来,以便后续使用。
3、自动生成四种文件:可得到DTI扫描的梯度编码文件.bval和.bvec,以及转换后
的NIFTI格式的图像文件。(文件名过长时可修改文件名)
3、应用bvec文件,构建适用于DTIstudio的文件
具体见:“DtiStudio读梯度表.bvec的方法步骤”文件
xlswrite('F:',b,'Sheet1','A1:C16')
(这里要注意修改文件路径;C16代表有多少个扩散方向,也要注意修改数值,这个值
可以根据转换时的文件中所看到的volumes值确定。
此处可知volumes=16
)
注意:当从word转换完成后用.txt文件保存,以便后续使用
二、DTIstudio 处理
软件:DTIstudio
具体详细参考见:“DTI数据处理流程_”文件
1、MRI View3D
打开DTI studio, File -> MRI View3D,选中上一步得到的.img文件,Image Parameters中
选择Image File Format为Analyze,点击OK
注意:在此界面中要注意下图中的Axial(轴向
轴向
)的片层大小,看一下最大到几(此列中
为38)便于计算张量时使用
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