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2024年6月9日发(作者:)

DTI数据处理流程:

一、原始数据格式转换

软件:MRIcroN中的 

步骤: 

1、打开软件,选择Output Format:4D NIfTI hdr/img 

2、选择要转换的数据(.dcm文件)所在的文件夹,并选择输出数据存放的文件夹(在

help中可选择,默认与原始数据在统一文件夹),数据自动转换,转换完成后提示如上

图。可以将这个内容用记事本保存下来,以便后续使用。

3、自动生成四种文件:可得到DTI扫描的梯度编码文件.bval和.bvec,以及转换后

的NIFTI格式的图像文件。(文件名过长时可修改文件名)

3、应用bvec文件,构建适用于DTIstudio的文件

具体见:“DtiStudio读梯度表.bvec的方法步骤”文件

xlswrite('F:',b,'Sheet1','A1:C16') 

(这里要注意修改文件路径;C16代表有多少个扩散方向,也要注意修改数值,这个值

可以根据转换时的文件中所看到的volumes值确定。

此处可知volumes=16 

注意:当从word转换完成后用.txt文件保存,以便后续使用

二、DTIstudio 处理

软件:DTIstudio 

具体详细参考见:“DTI数据处理流程_”文件

1、MRI View3D 

打开DTI studio, File -> MRI View3D,选中上一步得到的.img文件,Image Parameters中

选择Image File Format为Analyze,点击OK 

注意:在此界面中要注意下图中的Axial(轴向

轴向

)的片层大小,看一下最大到几(此列中

为38)便于计算张量时使用

本文标签: 文件转换注意数据选择