《计算机技术在生物学中的应用》课程教学大纲

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2024年7月18日发(作者：)

《计算机技术在生物学中的应用》课程教学大纲

一、课程基本信息

英文名称

课程编号

课程学分

适用专业

先修课程

后修课程

Apply of computer technique in biology

180111070

2学分/2学分

水产养殖专业

计算机文化基础

毕业论文、文献检索与论文写作

课程类型

课程学时

专业选修课

32学时/32学时

二、课程性质与定位

本课程是一门水产养殖专业选修课程，是计算机技术与现代生物学相结合的一门课程。本课程的

任务是通过该课程的学习使学生了解计算机技术与生物学科学研究的关系，掌握应用计算机技术解决

生物学诸多问题的技巧和方法，并熟悉网络技术在生物学研究中的作用，并熟知一些生物学领域常用

的生物学应用软件、文献管理软件、生物数据库资源等内容。使学生在以后的学习工作中能够应用本

课程所学的知识为学习、科研工作服务。

三、课程目标

1.知识目标

学习关于计算机技术的一些基础知识，以及生物学常用的计算机软件、数据库资源、网络资源、

生物学学习交流方法等知识。

2.能力目标

学习本课程能够使学生独立的应用生物学方面的计算机软件、数据库、网络资源为生物学的学习

和科研服务，增强学生学习水产养殖其他专业课程的能力、增强学生运用计算机分析和解决问题的能

力。

3.素质目标

学习本课程能够提高学生对计算机在生物学中应用的认知，帮助学生应用计算机更好更快的完成

学习、科研、生活等各方面的任务，为更好的运用计算机技术为人类服务打下坚实的基础。

四、主要内容和要求

第一章 绪论

【目的要求】

1、掌握学习和提高计算机应用能力的主要途径。

2、熟悉重要生物学软件及生物信息交流网站。

3、了解计算机基本原理和发展历史，回顾计算机硬件知识。

【教学设计建议】列举典型案例说明计算机技术在生物学中的应用，引起学生浓厚的学习兴趣

【讲授内容】

1、计算机硬件知识回顾、简要了解计算机基本原理和发展历史；

2、向同学展示学习和提高计算机应用能力的主要途径；

3、对重要的生物学软件及信息交流网站做简要介绍。

【自学内容】

1、各个生物学学习的专业网站，以及专业网站的注册与信息交流方法。

第二章 信息技术与电子计算机

【目的要求】

1、掌握信息技术的概念及计算机工作原理和数据的表示方法，以及信息数字化的基本原理。

2、了解计算机安全及保密的一般技术。

【教学设计建议】

【讲授内容】

1、信息技术与信息社会

2、电子计算机的发展和分类

3、电子计算机的基本结构

4、计算机工作原理和数据的表示方法

5、信息数字化

6、计算机的安全与保密

【自学内容】

第三章 网络基础及应用

【目的要求】

1、掌握网络基本组成，网络协议、局域网与校园网、广域网与因特网等概念。

2、熟悉电子邮件的使用，熟悉网上浏览、网上搜索和网上下载的常用方法和工具。

3、了解电子公告牌的使用。

【教学设计建议】用直观和形象的方法启发学生计算机网络。

【讲授内容】

1、计算机通信与网络基础：计算机通信；什么是网络；网络结构；网络的体系结构；网络的基本

组成；

2．网络协议：网络协议的概念；常见的协议；协议的制定；TCP/IP的结构；域名服务；域名服

务器；

3．局域网与校园网：局域网的基本概念；网络的拓扑结构；典型的网络；校园网；多媒体网络教

室；

4．广域网与因特网：广域网的概念；广域网的通信方式；广域网技术；Internet网络；中国互

联网络介绍；中国Internet发展情况；CERNET网络；

5．电子邮件的使用：电子邮件概述；配置Outlook Express；Outlook Express工作界面；编写

和发送邮件；阅读和回复邮件；在邮件中附加文件；通讯簿；

6．网上浏览、搜索与下载：网上浏览；网上搜索；网上下载；

7．电子公告牌；

9．网络技术与开放教学。药用菌物的鉴定依据和取样原则

【自学内容】

第四章 搜索引擎与生物学资源导航站点

【目的要求】

1、掌握搜索引擎的查询方法和技巧。

2、熟悉因特网上生物资源的查询途径。

3、了解Ftp资源搜索工具的使用及因特网资源使用的注意事项。

【教学设计建议】鼓励学生多实践多练习。

【讲授内容】

1、Internet 上生物资源的查询途径：通过搜索引擎查询；通过主题目录（Subject Directories )；

专业指南（subject Guides )；

2、搜索引擎的查询方法：搜索引擎的原理；搜索引擎检索方法；搜索引擎评价；搜索引擎与主题

目录及生物资源导航站点介绍；独立中文搜索引擎；常用英文搜索引擎（含主题目录）；主要英文元搜

索引擎介绍；常见的大专业主题指南站点介绍；重要生物资源导航站点介绍；国内生物医学导航站点；

3、非www生物资源检索途径：FTP资源检索工具；常用生物学 FTP 网址；

4、因特网涉及生物学习的资源介绍：生物学相关软件下载网址；部分生物学学习站点；

5、引用 Internet 资源的注意事项：对检索结果的评价；引用Internet资源的格式要求。

【自学内容】

第五章 因特网上的生物文献数据库

【目的要求】

1、掌握PubMed、Scirus、Ingenta等文献搜索引擎的使用。

2、掌握ISI Web of Science文摘型数据库的使用，以及Elsevier ScienceDirect、Kluwer

Academic、Springer、EBSCO、Blackwell、John Wiley Publisher等全文数据库的使用。

【教学设计建议】

【讲授内容】

1、文献搜索引擎：SCIRUS；INGENTA；INFOTRIEVE；PubMed；中国科学院国家科学数字图书馆 CSDL

跨库集成检索平台；

2、生物相关文摘型数据库：Biosis Preview （BA & BA/RRM）；ISI Web of Science；Silver Platter

系统及其数据库检索；采用WEBSPIRS平台的几个重要文摘数据库介绍（CAB、AGRICOLA、Agris、Food

Science and Technology Abstract （FSTA）、PEST-BANK害虫全集数据库-网络版）；其他与生物学相

关的文摘型数据库（Ei compendex、CA （Chemical Abstracts） & 13th cumulative Index、中国化

学文献数据库、中国科学引文数据库、中国生物医学期刊数据库、中国生物医学文献数据库、中文科

技期刊篇名数据库）；

3、全文库介绍：Elsevier ScienceDirect；Kluwer Academic；Springer；EBSCO；Blackwell；

John Wiley Publisher；Nature；Science；UMI Academic Research Library （ARL）；UMI Medical

Library；World scientific世界科学出版社全文电子期刊。

【自学内容】

第六章

个人文献的管理与特定文献数据库的构建

【目的要求】

1、掌握文献管理软件的工作原理。

2、熟悉个人文献数据库的构建方法及文献数据库的利用。

【教学设计建议】在讲解文献管理软件的基础上鼓励学生在课下多实践多练习

【讲授内容】

1、文献管理软件的共同特点：提供检索界面；创建参考文献数据库；将引文插入到字处理文档中；

可与图像或PDF文档相链接；创建独立的书目（参考文献列表）；

2、文献管理软件Endnote使用方法。

第七章 常用生物学软件简介

【目的要求】

1、了解分子生物学常用专业软件的应用范围和主要功能。

2、了解生物统计学领域常用专业软件的特点及应用。

3、了解专业图像处理软件及构型优化软件。

【教学设计建议】

【讲授内容】

1、origin； excel等著名数据处理软件的使用方法；

2、Blast；SigmaPlot；Harvard ChartXL；GraphPad Prism等生物统计学软件的使用；

3、ChemOffice; Chimera；BandScan; Amira等图像处理软件的使用。

【自学内容】

五、教学条件

本课程的教学需要多媒体教室，在条件允许的条件下可以鼓励学生上机操作各种生物学方面的重

要软件。

六、学时分配建议表

理论教学内容

第一章 绪论

第二章信息技术与电子计算机

第三章 网络基础及应用

第四章 搜索引擎与生物学资源导航站点

第五章 因特网上的生物文献数据库

第六章 个人文献的管理与特定文献数据库的构建

第七章 常用生物学软件简介

合计

学时

2

4

4

5

5

6

6

32

七、实施建议

1、教学组织

计算机技术在生物学中的应用是一门以实际应用为目的的课程，课堂教学以基本知识介绍为主，

不独立开设实验课，要求学生课后通过实际上机练习巩固课堂讲授内容。

2、教材选编

因计算机在生物学中的应用是一门集理论学习与亲身实践相结合的一门课程，关于计算机及生物

学中的一些基础知识前人已经编著了不少的教科书，因此结合教授本课程的亲身体会，可以着重选编

一系列应用型的小册子，以提高学生应用软件资源及网络资源的能力，为学生的深入学习服务。

3、教学团队

课程负责人及主讲教师具有十余年的教学经验，并有五年以上应用计算机解决生物学中诸多问题

的经历，能够胜任本课程的教学。教师知识结构合理、年龄都在40岁以下、年富力强。

4、教学评价

评价方法分为平时成绩和期末成绩两方面，其中平时成绩(60%)包括课堂提问、学生作业、课堂讨

论及演讲部分，期末成绩占总成绩的40%。

5、教学资源

本课程所配备的教学资源有限，但网络资源非常丰富，因此鼓励学生多多练习，并运用网络及计

算机相关知识解决生物学学习中的实际问题。

八、有关说明

无

本文标签： 生物学课程学生学习应用