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2024年4月24日发(作者：)
使用Discovery Studio进行化合物ADMET性质预测教程
目的：采用Discovery Studio，以一组小分子化合物为实例，计算其ADMET性质并对预测
结果进行分析。
所需功能和模块：Discovery Studio Visualizer Client和DS ADMET。
所需数据文件：。
所需时间：10分钟
介绍
ADMET性质是指分子在有机体内的吸收、分布、代谢、排泄和毒性等性质。如果在药
物研发的早期阶段就能依据化合物的ADMET性质对先导化合物进行有针对性的选取和优
化改造，这对提高药物研发的成功率以及减少药物研发后期过程中由于ADMET性质问题
所造成的资金浪费问题，是非常必要的。ADMET描述符可以有助于及早排除ADMET性质
不好的化合物从而避免后期耗资巨大的结构改造，同时也可以评价结构优化的效果，是否确
实改善了ADMET属性，从而避免合成所支出的过多资源。
本教程主要介绍了在Discovery Studio中如何进行化合物ADMET性质的预测，以及预
测结果的分析。
本教程包括：
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运行ADMET性质计算流程
分析ADMET性质预测结果
Discovery Studio中可以计算的ADMET性质包括：
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25摄氏度下水溶解度（aqueous solubility）
血脑屏障通透性（Blood brain barrier penetration，BBB）
细胞色素P450 2D6抑制性（Cytochrome P4502D6 inhibition）
肝毒性（hepatotoxicity）
人类肠道吸收性（human intestinal absorption，HIA）
血浆蛋白结合率（plasma protein binding）
运行ADMET性质计算流程
1. 导入小分子化合物文件
在文件浏览器（Files Explorer）中，展开Samples | Tutorials | QSAR，双击打开文
件。
在表格浏览器中可以看到一共有20个丙酮酸盐激酶抑制剂。
2. 选择计算性质，运行计算流程
在工具浏览器（Tools Explorer）中，展开Small Molecules | Calculate Molecular Properties，
点击ADMET Descriptors，打开ADMET Descriptors对话框。
点击Input Ligands右边的栅格，选择下拉列表中的pk-test:All，选择所有小分子化合物。
注：如果pk-test Molecule窗口已经打开，那么该处会自动设置。
ADMET Descriptors参数选择默认设置，即选取所有ADMET性质。（图1）
此操作将计算所有小分子化合物的所有ADMET性质。
图1“ADMET Descriptors”流程参数设置
点击Run运行作业。
等待作业完成。
注：该作业完成时间在30s以内（CPU为2.4GHz的计算机）。
为清晰起见，从菜单栏中选择Window | Close All关闭不必要窗口。
分析预测结果
待作业完成后，自动跳出一个对话框（图2）。
或者待作业完成后，双击作业浏览器（Jobs Explorer）中相应的行，打开Report页面。点击
View Results按钮。同样会跳出该对话框。
版权声明：本文标题：Discovery Studio官方教程--ADMET预测药物代谢动力学 内容由热心网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：https://m.elefans.com/xitong/1713902781a377253.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。
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