中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析

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2023年12月19日发(作者：)

中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析

代玉立;兰成忠;甘林;刘晓菲;龚国淑;杨秀娟

【期刊名称】《植物保护》

【年(卷),期】2022(48)6

【摘 要】由丁香假单胞菌猕猴桃致病变种Pseudomonas syringae

diae(Psa)侵染引起的猕猴桃细菌性溃疡病(kiwifruit bacterial canker)是全球猕猴桃生产上最具毁灭性的细菌病害。为探明福建、安徽、四川和陕西4省Psa菌株的生物型和遗传多样性,用5对PCR特异性引物PsaJ-F/-R、PsaK-F/-R、Tac-F/-R、Con002-F/-R和avrRps4-F1/-R2检测Psa菌株的生物型;用4对PCR引物27F/1492R、PsaF1/R2、gapA-Fps/Rps和rpoD+364s/-1222ps分别扩增16S rRNA、ITS、gapA和rpoD基因,进行多基因联合分析Psa菌株的遗传多样性。结果表明,特异性引物Tac-F/-R从47株Psa菌株中均能扩增出一条545 bp的特异条带,其他4对引物未扩增出任何条带,说明供试Psa菌株的生物型均为biovar 3。多基因联合分析表明,4省Psa存在丰富的遗传多样性,4个群体共检测出27个单倍型,单倍型多样性为0.955。安徽、福建、四川和陕西群体的单倍型数差异较大,分别为1、8、12个和12个。4个群体的多态性位点数、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数差异极显著(P<0.01),其中福建群体的多态性最丰富,而安徽群体的多态性最低。AMOVA分析表明,3.6%的遗传变异来源于种群间,而96.4%的遗传变异来源于种群内,说明种群内变异是遗传变异的主要来源。遗传分化分析表明,安徽省Psa群体与其他3个群体间的遗传分化极高(Fst>0.175),福建、四川和陕西群体间的遗传分化水平较低(Fst<0.017)。研究结果有利于了解福建省Psa

的来源,为阻断Psa的传播和猕猴桃细菌性溃疡病的长期可持续控制提供了理论参考。

【总页数】11页(P58-68)

【作 者】代玉立;兰成忠;甘林;刘晓菲;龚国淑;杨秀娟

【作者单位】福建省农业科学院植物保护研究所;四川农业大学农学院

【正文语种】中 文

【中图分类】S432.1

【相关文献】

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本文标签： 细菌性遗传猕猴桃群体病菌